Membres de l’équipe de la plateforme de métabolomique​

• Guido Kroemer, Responsable scientifique
• Sylvère Durand, Responsable opérationnel
• Mélanie Bourgin, Biochimiste Post-doctorante
• Fanny Aprahamian, Assistante technique
• Nitharsshini Nirmalathasan, Apprentie

Plateforme de métabolomique

La plateforme est équipée de quatre systèmes chromatographie/spectromètre de masse complémentaires, ainsi que

Plateforme de métabolomique

Les spectromètres de masse équipant la plateforme métabolomique permettent la mesure de toutes les classes potentielles de métabolites, aussi bien pour des approches ciblées que non ciblées.

Le profilage (non-ciblé) est réalisé au moyen d’un spectromètre de masse haute résolution (high resolution mass spectrometer, HRMS) couplé à une chromatographie ultra haute performance (ultra-high performance liquid chromatography, UHPLC).

Le but des essais cliniques est d'améliorer la prise en charge et le traitement des patients, à tous les stades de la maladie. Ils permettent d’évaluer l’efficacité et la tolérance de nouveaux traitements avant de les proposer à tous les patients concernés.

Members de l'équipe

• Responsable : Nathalie DROIN, PhD
  (nathalie.droin@gustaveroussy.fr)
• Marie BRECKLER, Technicienne de laboratoire
• Betty LEITE, Technicienne de laboratoire
• Audrey NAIMO, Technicienne de laboratoire
• Maëla FRANCILLETTE, Ingénieure
• Béatrice FIET, Assistante de gestion

Adresse email collective : GD-UGF@gustaveroussy.fr

Equipement

• 2 Bioanalyzer 2100 (Agilent)
• 1 FragmentAnalyzer (Agilent)
• 1 S220 Ultrasonicator (Covaris)
• 1 E220 Ultrasonicator (Covaris)

• 1 Robot Bravo (Agilent)
• 1 Robot SpriWorks (Beckman)

• 2 Chromium™ Controller (10X Genomics)
• 1 Tapestri (Mission Bio)

• 1 NovaSeq6000 (Illumina)
• 1 MiSeq (Illumina)
• 1 MiniSeq (Illumina)
• 1 PromethION 48 (Oxford Nanopore)

Plateforme de génomique fondamentale

La plateforme de Génomique de l’US AMMICa (INSERM US23 / CNRS UMS3655) de Gustave Roussy a pour mission de caractériser les cancers et les modèles expérimentaux grâce à des approches de génomique innovantes.

En 2011, la plateforme de génomique a mis en place un module de séquençage à haut débit basé sur la technologie d’Illumina (HiSeq 2000 remplacé par un NovaSeq 6000 en 2017, MiSeq et MiniSeq) et tous les équipements nécessaires qui entourent ces séquenceurs (robots pour les préparations pré-analytiques et des serveurs).