Plateforme de métabolomique
Les spectromètres de masse équipant la plateforme métabolomique permettent la mesure de toutes les classes potentielles de métabolites, aussi bien pour des approches ciblées que non ciblées.
Le profilage (non-ciblé) est réalisé au moyen d’un spectromètre de masse haute résolution (high resolution mass spectrometer, HRMS) couplé à une chromatographie ultra haute performance (ultra-high performance liquid chromatography, UHPLC).
L’analyse métabolomique ciblée repose sur la technique MRM (multiple reaction monitoring) après séparation par UHPLC, chromatographie en phase gazeuse (GC) ou par mobilité ionique (SelexIon), en fonction des propriétés du métabolite d’intérêt.
Nous quantifions en routine acides aminés et dérivés, acides gras, acyl-carnitines, nucléotides, co-facteurs, vitamines, lipides neutres et les molécules de la glycolyse et du cycle de Krebs, ainsi que les tri/di/mono-acylglycerides.
Les analyses peuvent être effectuées sur divers types d’extraits d’échantillons biologiques, dans un contexte clinique et pré-clinique, comme des biofluides, contenus fecaux et tissus issus de cohortes humaines, d’expérimentations animales ou des cellules en culture (adhérentes ou en suspension).
La technologie d'imagerie par spectrometrie de masse permet à la plateforme d'analyser de manière non-biaisée la distribution spatiale de milliers de métabolites, au sein de tissus biologiques et de cultures cellulaires.
La plateforme rassemble tous les moyens techniques requis lors d’un projet métabolomique, depuis l’extraction des métabolites de la matrice biologique jusqu’à l’analyse des données et le rendu des résultats.
Prestations proposées
- Profilage non-biaisé d’échantillons biologiques par UHPLC/q-Exactive.
- Analyse semi-quantitative de larges gammes de molécules endogènes.
- Élucidation structurale par MS Haute Résolution.
- Recherche de produits de métabolisation de médicaments par MS Haute Résolution.
- Analyse quantitative de métabolites candidats.
- Assister les scientifiques tout au long du projet métabolomique, incluant les étapes pré- et post-analytiques.
- Aider à définir les questions découlant du projet et le design expérimental y répondant.
- Mise en place de protocoles d’extraction adaptés à la nature des échantillons.
- Intégration des données métabolomiques pour l'analyse statistique.
- Aide à l’interprétation biologique, dans le contexte expérimental.
